基因组学与应用生物学

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《基因组学与应用生物学》 关注(): 期刊周期：双月刊; 期刊级别：北大核心; 国内统一刊号：45-1369/Q; 国际标准刊号：1674-568X; 主办单位：广西大学; 主管单位：广西大学; 查看基因组学与应用生物学近十年数据入口>>>; 上一本期杂志：《遗传》生物医学论文发表; 下一本期杂志：《生理学报》医生评职称论文发表

　　【杂志简介】

　　《基因组学与应用生物学》为基因组时代的理论与应用生物学提供服务的科学杂志,将面向基因组学、分子遗传学、生化与分子生物学等基础学科领域，着重刊登农林科学、医药科学、动物科学、环境、生态领域的研究成果。

　　【收录情况】

　　国家新闻出版总署收录

　　该刊被以下数据库收录：CA 化学文摘(美)(2009)、Pж(AJ) 文摘杂志(俄)(2009)、中国科学引文数据库(CSCD—2008)

　　核心期刊：中文核心期刊(2008)

　　期刊荣誉：中科双效期刊、Caj-cd规范获奖期刊

　　【栏目设置】

　　主要栏目：综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

　　杂志优秀目录参考：

　　RASSF6在结直肠癌中的表达研究陈尔飞;贺红娟;刘瑞涛;王檬;杨进1357-1360

　　基于沙眼衣原体ompl基因限制性片段长度多态性和测序法用于女性生殖道感染沙眼衣原体基因分型陈煜岊;邓国明;徐鹏;杨岚;陈静;蒋燕明1361-1366

　　人小细胞肺癌细胞株中CNDP2的检测及意义林星谷;陈迎春;韦艳萍;龙骏;姚姿婷1367-1371

　　葡萄糖转运蛋白的转运机制研究江诚;谢俊;陈海峰1372-1377

　　人CCR1蛋白真核表达载体在稳转细胞中的构建及其鉴定白靖琨1378-1383

　　一名肥胖儿童营养干预后肠道内假小链双歧杆菌碳水化合物利用能力的探究吴欢;王睿瑞;赵宇峰;庞小燕;申剑;张晨虹1384-1391

　　新余市CRF01-AE亚型人类免疫缺陷病毒的分子流行病学及其抗病毒治疗的研究潘虹;刘芳宇;周银古;晏火兰;毛尚根;付小园;丁勇1392-1397

　　不相容双质粒共表达霍乱毒素类似嵌合蛋白周小芬;林卫萍;何华红;李想;张焜;杜志云;王华倩1398-1405

　　牦牛和水牛全基因组微卫星分布规律及其比较分析戚文华;蒋雪梅;杜联明;肖国生1406-1412

　　关岭牛MyoD基因原核表达载体的构建及生物信息学分析夏丹;许厚强;陈伟;陈祥;周迪;张雯;桓聪聪;赵焕平;张青青;孙成娟1413-1420

　　马氏珠母贝组蛋白H3基因的克隆与表达特性分析潘晓艳;郑哲;田荣荣;焦钰;杜晓东1421-1428

　　微波辅助CDA酶法制备烹饪后龙虾壳聚糖及初步表征窦勇;胡佩红;顾鹏程;沈媛媛1429-1434

　　砂藓ATP合酶Ⅱ亚基基因的克隆及表达分析周伯;沙伟;张梅娟;张春蕾;索荔1435-1442

　　十字花科黑腐病菌中一个与HR反应相关的小RNA的鉴定李良贤;肖波;黄晓韵;唐东阶1443-1450

　　锻压技术期刊投稿：炼铁技术系统的物质流与能量流探讨

　　摘要：本文从炼铁系统的物质流和能源流两个方面出发，对炼铁系统所消耗的能源和资源情况进行了详细分析。

　　【关键词】炼铁系统,物质流,能源流

　　近年来，全球气温开始变暖，对自然环境和人类生活造成了严重影响。钢铁行业生产和运行的过程中所产生的能源消耗，废弃排放是致使全球气温升高的主要原因，因而受到了社会的广泛关注。钢铁联合企业中，炼铁系统的能耗和二氧化碳的排放对气温影响最为严重。碳素是炼铁系统消耗的主要能源，而碳素在燃烧过程中会释放大量CO2。因此，为了保证人类拥有健康美好的生活环境，为了建设节约型社会，必须提高炼铁系统的能源效率。

　　基因组学与应用生物学最新期刊目录

鳖甲煎丸抑制肝癌细胞的环状RNA表达谱分析————作者：林洪升;谭金娜;方巧玲;杜柯薇;何佳倩;王运踊;鲁晓航;潘爱萍;李明芬;

摘要：本研究主要探讨环状RNA（circular RNA， circRNA）在鳖甲煎丸抑制肝癌进展过程中的表达变化及分子机制。利用find＿circ和CIRI算法、KEGG通路和GSEA富集分析，对circRNA的表达及特征进行深入研究。采用彗星实验检测鳖甲煎丸含药血清对肝癌细胞DNA损伤的影响，并通过β-半乳糖苷酶染色评估其对肝癌细胞衰老的诱导作用以及划痕实验用于检测细胞迁移能力的变化。此外，还构建了...

基于荧光蛋白的植物可变剪切报告系统的构建————作者：唐茜;聂奕;王文慧;陈雨晴;魏济帆;黄予;陈怡君;刘柯颍;蔡文国;

摘要：内含子剪切是真核生物转录后修饰重要环节，是重要的基因表达调控方式。植物中多数基因存在可变剪切，能形成不同的剪切形式。然而对植物可变剪切因子的研究尚待深入。在这个报告系统中，编码绿色荧光蛋白的基因被插入了一个含有终止密码子的内含子以中断荧光蛋白的表达，而当内含子被正常剪切时能表达出绿色荧光蛋白。通过在烟草中进行瞬时表达实验，该系统可对植物可变剪切的效率进行定性与定量评估。此报告系统的建立为研究剪切辅...

马立克病毒pUL41宿主互作蛋白的鉴定及调控网络分析————作者：袁庆杨;冯伟民;黄腾;

摘要：马立克病毒（Marek's disease virus，MDV）是一种重要的致瘤性疱疹病毒，给养鸡业带来严重的疾病负担。MDV UL41基因产物pUL41是一种独特的核糖核酸酶，可能参与调节宿主细胞的多种生物学功能，以利于病毒逃避宿主免疫。为了探索MDV pUL41对宿主细胞信号网络产生的广泛影响，本研究首先通过免疫沉淀从感染的鸡胚成纤维细胞富集与pUL41结合的蛋白，再利用液相色谱串联质谱技术（...

结肠癌细胞外泌体circ-SLC38A2靶向miR-10a-5p调控肝星状细胞LX2活化————作者：张晓静;李景武;安娜;韩龙才;李青科;卢琳;王昊天;刘艳坤;

摘要：外泌体环状RNA（circular RNAs，circRNAs）是重塑肿瘤微环境的关键调控因子。本研究探讨外泌体circRNA通过靶向miR-10a-5p调控LX2活化，重点阐明它们在肝转移微环境形成中的分子机制。首先，利用生物信息学技术和双荧光素酶实验预测并验证调控miR-10a-5p上游的靶向circRNA；实时定量PCR（Real-time quantitative PCR，RT-qPCR）...

基于蛋白质组学探讨芍药苷抗帕金森病的作用机制————作者：冯真;薛慧铭;金畅;张月;郑梅竹;

摘要：为阐明芍药苷抗帕金森病的具体靶点和信号通路，本研究通过MPP⁺诱导损伤的PC12帕金森细胞模型，结合蛋白质组学分析芍药苷对PC12损伤细胞的保护作用及其潜在靶点和机制。细胞实验结果表明经芍药苷处理的细胞组与MPP⁺诱导损伤对照组相比，芍药苷能显著提高MPP⁺诱导损伤PC12细胞的存活率，对其有显著的保护作用，通过蛋白质组学的分析，共...

骨钙素在考古学研究中的应用————作者：袁梦;凌雪;赵丛苍;

摘要：骨钙素是一种由成熟成骨细胞分泌的维生素K依赖性钙结合蛋白，作为骨骼中含量最多的非胶原蛋白，它被认为是骨形成和骨转换的重要标志。由于其在骨骼中的高稳定性和低污染风险，骨钙素在考古学研究中显示出极大的应用前景。然而，国内对于骨钙素的考古学研究尚显不足。本文系统梳理了骨钙素的生物学特性，阐述了其在考古学领域中判断个体年龄段和性别、获取准确的碳氮同位素数据、分析先民的生存压力和疾病状况、建立系统发育关系等...

甘蔗茎秆细胞壁力学性能————作者：刘庆庭;张晨琦;林志超;黄瑶;李桃;李志昂;

摘要：细胞是作物承受外力的基本单元，细胞壁是细胞承受外力的基本单元，了解细胞的力学性能首先需要研究细胞壁的力学性能。细胞壁的力学性能可以通过试验直接测得。目前测试细胞壁弹性模量的方法主要有原子力显微镜技术(Peakforce QNM模式)和纳米压痕技术。原子力显微镜技术测得的细胞壁各子层弹性模量为精细模量。该测试方法对各子层之间的变化具有高分辨率表征作用，适用于尺寸较小的细胞壁各子层模量表征分析。纳米压...

棉花愈伤组织诱导过程中的DNA甲基化分析————作者：胡蝶;李雪林;梁华;

摘要：为了解棉花(Gossypium spp.)体细胞胚胎发生过程中早期非胚性愈伤组织诱导的表观遗传学变化，利用全基因组甲基化测序(whole-genome bisulfite sequencing, WGBS)技术，对陆地棉(Gossypium hirsutum)品系‘YZ1’的下胚轴和非胚性愈伤组织进行DNA测序，并对其甲基化变化进行对比分析。结果表明，在棉花非胚性愈伤组织诱导过程中发生了整体甲基化...

基于BOPPPS模式的遗传学线上线下混合教学实践——以“植物雄性不育”教学内容为例————作者：罗继景;黄婧;岑卫健;

摘要：虽然目前传统的遗传学教学已经取得了很多成绩，但是仍存在一些不足，比如教学方式方法单一，教学内容单调，学生参与度低等。近年来，现代信息技术的飞速发展和新教学理念的提出进一步推动和促进了教学模式的改革。因此，为深入推进遗传学的教学改革，本文介绍了基于BOPPPS教学模式，利用在线教学平台雨课堂开展的遗传学线上线下混合教学的探索与实践经验，并以教学内容“植物雄性不育”为例介绍教学实施的过程。整个教学过程...

植物免疫信号分子NHP结合蛋白的虚拟筛选————作者：黄财;刘诗敏;何聪慧;蒋锌泉;苏子惠;杨婧艺;傅琼;明振华;

摘要：植物代谢产物N-羟基哌啶酸(N-hydroxy-pipecolic acid, NHP)是植物系统获得性抗性(systemic acquired resistance, SAR)中关键的移动信号分子。然而，NHP的受体蛋白及调控其代谢、修饰和运输的关键蛋白仍不明确。本研究针对拟南芥(Arabidopsis thaliana)中受NHP诱导高表达的1 883个基因，通过AlphaFill数据库筛选具...

PBX1生物学功能研究进展————作者：李雯;王培昌;宋乔;

摘要：前B细胞白血病同源盒转录因子1（pre-B-cell leukemia homeobox transcription factor 1， PBX1）是一种进化上高度保守的同源结构域蛋白，在细胞代谢、组织和器官的发育和分化等多个胚胎发育过程中发挥关键作用。PBX1作为一种“先锋转录因子”，可以增加染色质可及性，激活并促进骨骼肌分化和乳腺癌增殖相关靶基因的转录。PBX1缺失会影响胚胎时期多种器官的正常...

三个促进橡胶树白粉菌致病的效应蛋白鉴定————作者：左明浩;刘玉涵;殷金瑶;单佳馨;何礼娟;刘文波;缪卫国;李潇;

摘要：植物病原真菌通过分泌效应蛋白破坏寄主免疫反应，促进其侵染和定殖。白粉菌是专性寄生活体营养型真菌，可以分泌特有的候选分泌效应蛋白(candidate secreted effector proteins， CSEPs)，但这些CSEPs是否促进白粉菌致病仍了解较少。橡胶树白粉菌(Erysiphe quercicola)可引起橡胶树白粉病并危害天然橡胶产量。本研究首先对5个具有较高保守性的橡胶树白粉菌...

犬细小病毒病的组学研究进展————作者：艾馨;王浩荣;张亦凡;谢佳良;于昊;金健佑;田茹萌;马浩原;许家翠;高旭;

摘要：犬细小病毒病（canine parvovirus disease，CPVD）是由犬细小病毒（canine parvovirus，CPV）引起的一种犬的急性、烈性、高致死性传染病。该病虽有疫苗进行防控，但常有免疫失败的报道。CPV的致病机制及宿主的防御机理还未完全阐明。尽管单个基因、蛋白和通路的研究是阐明各种机理的必需研究内容，但各种组学研究也为病毒病相关研究提供了重要的补充和新的理解视角。本文综述...

JCVI:用于比较基因组学分析的多功能工具包————作者：张以星;王争光;谭月;吴婷婷;齐浥颖;王宇浩;黄育敏;张积森;唐海宝;

摘要：随着高通量测序技术的快速发展，越来越多物种的基因组组装、注释，以及比较基因组学研究得到开展。尽管已有各类工具可以分别处理这些步骤，但用户对能够整合这些不同工具的解决方案的需求日益增加。在此，本文介绍了JCVI库，这是一个功能多样的基于Python的库，其模块化设计能够处理格式解析、图形生成、基因组挂载和植物表型提取等多种任务。该库以BSD-2-Clause许可证发布，用户可在https://git...

甜橙淀粉合成相关基因鉴定及应答病原菌感染的表达模式分析————作者：刘新军;曾宪章;包凯强;李瑞民;

摘要：柑橘黄龙病导致柑橘属(Citrus)植物叶片出现异常的淀粉积累，其分子机制尚未明确。为解析淀粉代谢生物学过程在柑橘与黄龙病菌互作过程中的作用，本研究利用生物信息学手段鉴定甜橙(Citrus sinensis)的淀粉合成相关基因，分析甜橙淀粉合成相关基因的染色体分布、系统发生关系、基因结构和启动子区域顺式作用元件，鉴定编码蛋白的保守基序和结构域，探索甜橙淀粉合成相关基因在柑橘黄龙病菌(Candida...

PI4KB蛋白的多克隆抗体制备及其对禽传染性支气管炎病毒复制的影响————作者：张桃妮;张愉;晋英浩;陈胜婷;董轩铭;刘玲;李杰宁;磨美兰;

摘要：许多正链RNA病毒通过劫持宿主细胞的磷脂酰-4-肌醇激酶β（phosphatidylinositol 4-kinase beta， PI4KB）来富集磷脂酰-4-肌醇（phosphatidylinositol-4 phosphate， PI4P），进而促进病毒的复制。为探究PI4KB是否影响禽传染性支气管炎病毒（infectious bronchitis virus， IBV）的复制，本研究首次制...

基因组学与应用生物学论文撰写指南

摘要：<正>一、栏目设置本刊设置固定栏目和随机栏目。固定栏目常设研究论文,发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源设述评及其他栏目。二、论文写作的基本要求1题目与标题论文题目要紧扣主题,务求简明、新颖,有足够的信息,能引起读者的兴趣,不用副标题,一般不宜超过25个汉字或英文单词。应使用标准术语、学名全称、药物和化学品通用名称,不宜使用广义术语、夸张词语等,同时避免在题目中使用不常用的缩写词

基因组学与应用生物学作者投稿指南

摘要：<正>1刊登范围本刊主要刊登植物、动物和微生物基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等组学,分子医学、现代生物技术等应用生物学研究的未发表的创新性研究成果,以及上述领域的综述论文。2栏目设置本刊设置固定栏目和随机栏目。固定栏目常设研究论文,发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源设述评及其他栏目

基因原位回补技术及其在囊状匍柄霉中的应用————作者：邓心怡;曹俊杰;周倩;

摘要：囊状匍柄霉（Stemphylium vesicarium）是无性态真菌中的重要类群，在世界范围内广泛存在，可危害多种作物，造成严重经济损失。前期研究发现一种转运蛋白基因SvMFS1敲除后突变株表型变化明显，载体回补后表型却并未完全恢复。本研究基于Split-marker技术建立了敲除基因原位回补技术，通过比较载体回补转化子与原位回补转化子表型、目的基因表达量、致病性及毒素Altersolanol ...

细菌抗噬菌体的免疫功能及其研究进展————作者：周玉婷;龙中儿;

摘要：在抵御噬菌体侵袭的生存竞争中，细菌进化出完善的免疫系统，包括先天免疫和适应性免疫、被动免疫和主动免疫等多种免疫方式。本文系统地分析了细菌通过调控噬菌体受体基因表达、分泌胞外基质遮蔽及利用受体竞争性抑制剂等多样化的策略抑制噬菌体吸附；通过超感染排斥系统阻止噬菌体DNA进入细胞内部；通过RM和CRISPR-Cas系统等阻断噬菌体DNA的复制和表达；如果噬菌体成功突破这两道防线，细菌可通过TA和Rex系...

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