SCI分区就是按照论文的档次，给论文进行一个等级划分。按照该期刊的影响因子，投稿难度和影响力进行分区。那么SCI分区依据是什么?基于SCI收录期刊影响因子基础之上进行分区的，影响较为广泛的有两种：一种是 Thomson Reuters 公司制定的分区(中文一般翻译为汤森路透分区);另一种是中国科学院国家科学图书馆制定的分区(简称中科院分区)。
汤森路透分区
汤森路透每年出版一本《期刊引用报告》(Journal Citation Reports，简称JCR)。JCR对86 000多种SCI期刊的影响因子(Impact Factor)等指数加以统计。JCR将收录期刊分为176个不同学科类别。
每个学科分类按照期刊的影响因子高低，平均分为Q1、Q2、Q3和Q4四个区：各学科分类中影响因子前25%(含25%)期刊划分为Q1区，前25%～50% (含50%)为Q2区，前50%～75% (含75% )为Q3区， 75%之后的为Q4区。汤森路透分区中期刊的数量是均匀分为四个部分。
中科院分区
中科院首先将JCR中所有期刊分为数学、物理、化学、生物、地学、天文、工程技术、医学、环境科学、农林科学、社会科学、管理科学及综合性期刊13 大类。然后，将13大类期刊分各自为4 个等级，即4 个区。
按照各类期刊影响因子划分，前5% 为该类1 区、6% ～ 20% 为2 区、21% ～ 50% 为3 区，其余的为4 区。显然在中科院的分区中，1区和2区杂志很少，杂志质量相对也高，基本都是本领域的顶级期刊。中科院分区中四个区的期刊数量是从1区到4区呈金字塔状分布。
两者最大的不同在于分区方法。在中科院期刊分区表中，主要参考3年平均IF作为学术影响力，最终每个分区的期刊累积学术影响力是相同的，各区的期刊数量由高到底呈金字塔式分布;在JCR的Journal Ranking中，主要参考当年IF，最终每个分区的期刊数量是均分的。
